2018年以来，海南大学科研实力快速提升，截至2025年12月31日，全校自然科学领域共立项项目8889项，立项项目总经费36.96亿元；学校国家级项目的立项数和立项经费呈现较快增长趋势。据统计，国家级项目共立项1711项，立项经费合计11.05亿元。其中 2025 年，国家级项目立项 338 项，是 2017年的 3.1倍；国家级项目立项经费2.32亿元，是2017年的4.51倍。

在国家自然科学基金方面 ，2018年以来，学校共立项1532项，立项经费总计6.47亿，立项数连续 8年创历史新高。2020年，共立项106项，首次突破100项大关。2021年，立项157项，较2020年增幅近50%。2022年，立项数、立项经费、重点项目均取得历史性突破，全校立项218项，全国排名首次进入前50位，同比增幅37.11%，增幅居全国第二；立项经费1.05亿元，首次突破亿元大关，同比2021年增幅69.35%；立项重点类项目13项，是历年来重点类项目总数的2.6倍；重点项目、国家重大仪器专研制项目、青年科学基金B类（原优秀青年基金项目）、区域创新发展联合基金项目等实现了学校零的突破。2023年，共立项270项，立项经费1.24亿元，其中集中期立项数全国排名提升至前40位，重点类项目进一步突破至15项。2024年，共立项278项，集中期立项数全国排名稳定保持在前40位。2025年，共立项327项，立项经费1.42亿元，立项数首次突破300大关，是2017年的4倍，其中集中期立项315项，排名跃居全国前30位；面上项目获批55项，数量较2024年实现翻倍增长，青年科学基金A类（原杰出青年基金项目）实现立项，为近5年来首次突破。

在国家重大科技专项和重点研发计划方面，2018以来，学校获批国家科技重大专项和重点研发计划共计167项，立项经费合计4.35亿元。2019年，学校首次牵头承担国家重点研发计划项目，获批项目牵头2项；2022年，首次牵头承担国家科技重大专项项目及国家重点研发计划青年科学家项目；2025年，实现国家科技重大专项单个课题获资助中央财政经费突破2000万元。